ハンター試験の1次試験の終わりから三次試験のトリックタワーに入るところまでが描かれている。ハンター試験の内容が本格化し、ヒソカやキルアといった主要キャラクターの正体や本質が明らかになっていくなど徐々にストーリーが深みを出し始めている。
またネテロの登場によりハンターの凄味に関しても明らかにされる。
1巻
主人公ゴンは世界最高峰のプロハンターであるジンの息子。くじら島で幼年時代を過ごしていたゴンはある日、不思議な男カイトに出会う。そこでゴンは父親の真の姿を知るようになりジンに会うべくハンターを目指すようになる。その後12歳になったゴンはハンター試験を受けるために住み慣れた島を出ることを決意する。
ノウコ
特徴
恐らくHUNTER×HUNTERを全巻読破している原作ファンの中ですらノウコの名前を知らない人は多いだろう。実際、原作において明確なセリフはなくアニメ版に至っては新旧通して登場すらしていない（もしかしたら隅のほうにいたかもしれないが）。
原作を幾度も読破している筋金入りのファンでなければその存在すら認知できない幻の存在で、ノウコを知っているかどうかでHUNTER×HUNTERに対するマニア度が分かる（自慢することでもないが）。
ノウコとはゴンと同じくじら島に住む住民でゴンよりも年下の女の子。くじら島にはゴンを除いてはノウコしか子どもがいなかったため子ども同士仲が良く、キメラアント編でのゴンの会話を聞く限りミトさんとおばさんの次に仲の良い人物だったようだ。早い話し、ジンとミトさんのような関係に近かった。ただし年齢が少し離れていたため毎日一緒に遊んでいたわけではない。
原作ではくじら島を出発するゴンに対し見送りをしているノウコの姿が描写されている。なおゴンがくじら島を旅立ってしまった現在、島で唯一の子どもだと考えられる。
人面猿
ルメーレ湿原に生息する魔獣で猿のような姿をしている。キリコのような魔獣と同じく人の姿に化けることができて、かつ人の言葉を話すことができる（最も人語を話せる動物を総称して魔獣と呼ぶらしいが）。ハンター試験の途中で試験官になりすまし受験生たちを騙そうとした。
ヒソカの放ったトランプ攻撃に対処できず絶命したが、変身の能力と言葉巧みに受験生を騙す技術はなかなかのものだった。
また試験の途中で数十キロもの距離を走り多くの人間が疲労して冷静な判断力を失っている時に行動を起こしたのも良いタイミングだったと言える。
病犬（やまいぬ）
陰獣の構成員で幻影旅団がオークション会場を襲った際に最初に討伐に駆けつけた一人。犬の名前通り鋭い牙を持つ能力者で鋼鉄よりも堅いウボォーギンの肌を噛み切った。歯の奥に即効性の神経毒を仕込んであり、病犬に噛まれた相手はたちどころに動きを封じられる。
ウボォーギンも例外ではなくしばらくすると行動の自由が利かなくなった。毒の性質上、首から上は通常通り動かすことが出来るため痛みを把握することは出来る。
フェイタンも言っていたが、致死性の猛毒を仕込んであればそれで勝負がついていた。それをせずに敢えて神経毒を使用しているのは病犬の拷問好きを象徴している（シャルナーク談）。
神経毒のお陰もあり当初は戦いを有利に進めていたが、ウボォーギンが口から吐き出した蛭の頭蓋骨を受けて絶命した。